治病必求于本，本乎阴阳。
阴阳是《黄帝内经》中的基础概念之一，如果不把阴阳弄清楚，研读经文中的医理就始终如雾里看花。天地阴阳以象推，人之阴阳以数计，以数计就会有具体的指向，因此本文通过归类总结，将经文中医理部分阴阳的主要涵义进行了具体划分，总结如下：
一、内外阴阳--皮肉筋骨为阳，五臓六腑为阴
二、臓腑阴阳--臓为阴，腑为阳
三、臓之阴阳--心肺为阳，肝脾肾为阴
四、营卫阴阳--营为阴，卫为阳
五、经脉阴阳--手足三阴、三阳经脉
六、脉之阴阳--寸口为阴，人迎为阳
--去者为阴，至者为阳
--静者为阴，动者为阳
--迟者为阴，数者为阳
七、气味阴阳--气为阳，味为阴
由于阴阳的应用随处可见，非常灵活多变，所以并不会仅限于本文所列出的分类，因此在学习医理的时候，还是应该努力探求阴阳的根本，以避免生搬硬套。
正文
阴阳者，天地之道也，万物之纲纪，变化之父母，生杀之本始，神明之府也。治病必求于本。
人由天地阴阳之气所生，人从出生的一刻开始，生命就由阴阳之气来维系，经历了一生的生长壮老巳，最终阴阳离绝，复归于天地。由于阴阳是生命存在的根本，所以治病也要从根本上医治。
一、内外阴阳--五臓六腑为阴，皮肉筋骨为阳
夫言人之阴阳，则外为阳，内为阴。
气在人身之中运转，以有形之身来分，气运转于外为阳，运转于内为阴。
阴中有阴，阳中有阳，审知阴阳，刺之有方。得病所始，刺之有理。谨度病端，与时相应，内合于五臓六腑，外合于筋骨皮肤。
外为阳，内为阴，阳中还有阴阳，阴中也还有阴阳，只有全面了解阴阳之所在，针刺时才会找到正确的方法。懂得病始于阴还是始于阳，针刺时才会符合理法。谨慎地思考病之所起，并且与一岁之内天地阴阳之气的变化相应，在内要合于五臓六腑，在外要合于皮肤筋骨才可以。
是故内有阴阳，外亦有阴阳。在内者，五臓为阴，六腑为阳；在外者，筋骨为阴，皮肤为阳。故曰，病在阴之阴者，刺阴之荥俞；病在阳之阳者，刺阳之合；病在阳之阴者，刺阴之经；病在阴之阳者，刺络脉。
在内还可细分阴阳，在外也可再细分阴阳。在内五臓为阴六腑为阳，在外筋骨为阴皮肤为阳。所以病在五臓的，可以刺阴经的荥穴与俞穴；病在皮肤的，可以刺阳经的合穴；病在筋骨的，可以刺阴经的经穴；病在六腑的，可以刺络脉。
故曰，病在阳者名曰风，病在阴者名曰痹，阴阳俱病名曰风痹。
所以从病的部位来区分，病在皮肤筋骨的称为风，病在五臓六腑的称为痹，内外俱病的称为风痹。
病有形而不痛者，阳之类也；无形而痛者，阴之类也。无形而痛者，其阳完而阴伤之也，急治其阴，无攻其阳。有形而不痛者，其阴完而阳伤之也，急治其阳，无攻其阴。阴阳俱动，乍有形，乍无形，加以烦心，命曰阴胜其阳，此谓不表不里，其形不久。
从病的症状来区分，外在可观察到形但不痛的属阳病，外在无形却痛的属阴病。无形而痛的，是因为外在完好但内在已伤，这时需急治阴分，不要动阳分。有外在之形而不痛的，是因为阴分完好而阳分受伤，这时需急治阳分，不要动阴分。如果内外同时发病，一时有形一时无形，观察病人又心情烦躁不安，那么这时就是阴分之病胜于阳分，这种情况称为不表不里，命不久矣。
黄帝问于伯高曰：余闻形气之病先后，外内之应奈何？伯高答曰：风寒伤形，忧恐忿怒伤气。气伤臓，乃病臓；寒伤形，乃应形；风伤筋脉，筋脉乃应。此形气外内之相应也。
外在之形与臓腑之气，其病有先有后，那么外内是如何相应的呢？
风寒伤外在之形，忧恐忿怒伤五臓之气。情志伤五臓，则五臓发病；寒伤外在之形，则外在之形发病；风伤筋脉，则筋脉发病。这就是天之邪气与人之情志所伤皆应于不同的部位。
二、臓腑阴阳--臓为阴，腑为阳
阳者天气也，主外；阴者地气也，主内。
在有形的天地之中，天在外，地在内，天包裹着地，无形的气在有形的天地间运转，气运转到天上称为天气、阳气，运转到地下称为地气、阴气。所以天气、阳气主外，地气、阴气主内。
故阳道实，阴道虚。故犯贼风虚邪者，阳受之；食饮不节，起居不时者，阴受之。阳受之则入六腑，阴受之则入五臓。入六腑则身热，不时卧，上为喘呼。入五臓则䐜满闭塞，下为飧泄，久为肠澼。
对于人身五臓六腑来说，六腑在外为阳，五臓在内为阴。六腑主受五谷而传化，所以阳道实；五臓主纳精而藏神，所以阴道虚。所以外来之贼风虚邪，会通过皮肤腠理先入于六腑；而食饮不节制，起居不守时所引发的病邪，则会先伤到五臓。邪入六腑，病发时会身热不得安卧，喘息声音粗大。邪入五臓，病发时会胀满闭塞不通，大便泄泻清稀，时间久了就会发展成肠澼。
故喉主天气，咽主地气。故阳受风气，阴受湿气。故阴气从足上行至头，而下行循臂至指端。阳气从手上行至头，而下行至足。故曰：阳病者上行极而下，阴病者下行极而上。故伤于风者上先受之，伤于湿者下先受之。
所以喉通外而通天气，咽通内而接地气。与六腑相通的阳经易受风邪，与五臓相通的阴经易受湿邪。当人呈双臂高举姿势时，就可以清楚地看到阴经是从足上行至头，再循臂至指端，而阳气正好相反，从手行至头，再下行至足。所以说，当人正常垂手而立时，阳经的病邪，是先上至头再往下走，而阴经的病邪，则是先下至四末再往上走。风在上，湿在下，所以风邪先中于身形之上，湿邪先中于身形之下。
三、臓之阴阳--心肺为阳，肝脾肾为阴
所以欲知阴中之阴，阳中之阳者，何也？为冬病在阴，夏病在阳，春病在阴，秋病在阳，皆视其所在为施针石也。
为什么要懂得阴中有阴，阳中有阳？这是因为冬病在肾，夏病在心，春病在肝，秋病在肺，都需要考察病症所在的部位而施用针刺和砭石来治疗。
故背为阳，阳中之阳，心也；背为阳，阳中之阴，肺也；腹为阴，阴中之阴，肾也；腹为阴，阴中之阳，肝也；腹为阴，阴中之至阴，脾也。
肝为牡臓...心为牡臓...脾为牝臓...肺为牝臓...肾为牝臓。
牝：阴
牡：阳
心肺在上，属阳；肝肾脾在下，属阴。进一步划分，心为牡臓，为阳中之阳；肺为牝臓，为阳中之阴；肾为牝臓，为阴中之阴；肝为牡臓，为阴中之阳；脾为牝臓，为阴中之至阴。
别于阴者，知死生之期。
通过阴经的脉象辨别出五臓的状态，就能预知生命的期限。
四、营卫阴阳--营为阴，卫为阳
阴者，藏精而起亟也；阳者，卫外而为固也。阴不胜其阳，则脉流薄疾，并乃狂；阳不胜其阴，则五臓气争，九窍不通。
营为阴，卫为阳。营气行于脉内，藏精血并不停地出脉而扶持卫气；卫气行于脉外，使皮肤腠理固密，以御外敌。卫气有余而营气不足时，营气就会运行急迫。如果营气不能正常出脉扶持卫气，卫气也不能正常外泄，就会惊狂。营气有余而卫气不足时，就会使五臓气血不均衡，从而气争于内，在外则九窍不通。
是以圣人陈阴阳，筋脉和同，骨髓坚固，气血皆从。如是则内外调和，邪不能害，耳目聪明，气立如故。
所以圣人遵循天地阴阳之气的规律，从而使筋脉调和协同，骨髓坚牢而固密，气血皆按正常路径和刻数运转不息。这样才会使有形之身内外之气协调通畅，外邪不能侵害，耳聪目明，气机如常运转。
（关于营卫阴阳，可具体参考《<生气通天论>》解析》）
五、经脉阴阳--手足三阴、三阳经脉
然其分别阴阳，皆有标本虚实所离之处。能别阴阳十二经者，知病之所生。候虚实之所在者，能得病之高下。知六腑之气街者，能知解结契绍于门户。能知虚实之坚软者，知补泻之所在。能知六经标本者，可以无惑于天下。
十二经脉每条经都有标本、虚实、离合。能够掌握十二经脉，就会知道病生于何经。考察经脉虚实之处，就会知道病之强弱。能够掌握六腑气街，就会知道如何在门户之处解开结聚，使气血运行畅通无阻。能够掌握虚实之处的坚软，就会知道在何处补泻。能够掌握十二经脉之标本，就可以对天下之病无惑了。
六、脉之阴阳
夫子言察阴阳所在而调之，论言人迎与寸口相应，若引绳小大齐等，命曰平。
阳是指人迎，阴是指寸口，人迎与寸口之脉大小齐等，才是平人脉象。
所谓阴阳者：去者为阴，至者为阳；静者为阴，动者为阳；迟者为阴，数者为阳。
脉象阴阳，也可按去阴至阳、静阴动阳、迟阴数阳来划分。
七、气味阴阳--气为阳，味为阴
阴味出下窍，阳气出上窍。味厚者为阴，薄为阴之阳。气厚者为阳，薄为阳之阴。味厚则泄，薄则通。气薄则发泄，厚则发热。
味质地重浊属阴，由下窍而出；气质地清扬属阳，由上窍而出。味中可再分阴阳，味厚者为阴中之阴，味薄者为阴中之阳。气中也可再分阴阳，气厚者为阳中之阳，气薄者为阳中之阴。气薄的可发汗，气厚的则会生热，味薄的可通利小便，味厚的可泻下。
是故谨和五味，骨正筋柔，气血以流，腠理以密，如是则骨气以精。谨道如法，长有天命。
所以谨慎地调和五味，就会使骨骼强健，筋脉柔韧，气血通畅，腠理密固，这样皮肉筋骨才会正气充足。所以谨遵天地阴阳之气的运行规律，以四时生长化收藏为法，才可以尽享天年。